Ubicado en un universo paralelo alrededor del período Edo. Especies alienígenas Amanto atacan al planeta Tierra. Las personas en la Tierra luchan contra los alienígenas por más de 10 años. El shogunato ve el poder de los Amanto y decide aceptar su conquista. El shogunato construye un gobierno títere para los Amanto y lleva a cabo el edicto de la abolición de la espada. Debido a estas acciones, los samuráis, que lucharon contra los Amanto por su país y su señor, caen en una decadencia.
Gintoki Sakata es un samurai y pasa a conocer gente. Tiene una experiencia extraordinaria.